明朝万历年间，许国诚根据史宗道编的《京口三山志》，请郡里的博士高一福增补修订，定名为《三山全志》，并且第一次把鹤林寺的内容也附在里面，鹤林寺这才有了自己的志书！这个版本是在明朝正德七年（1512年）初次刊印，后来在万历年间增补的，现在由国立中央图书馆代为保管的北平图书馆藏本就是这个。我们就是根据这个藏本，把其中的《鹤林寺志》（全志的第十二卷）影印出来。这个版本有不少残缺，现存的部分里有古迹、田土、诗、传、法语等类别。查对原来的页码顺序，这个版本缺了第二、六、十、十八这四页，但从现存的书中还有别的残页来看，知道这个版本缺的页数其实更多。现在因为没有别的版本可以对照，所以在缺页的地方，都留了空白页，等以后找到再补上。这里就这个版本缺的地方简单说明一下：① 第二页缺：这一页记载的是鹤林寺的建造和变迁历史。释明贤编的《鹤林寺志》里关于这部分的记载比我们这个志书要简略，参考价值不大。② 第六页缺：第五页最后一首诗是顾况的《寄江南鹤林寺石冰上人》，可以参考明贤志第六十四页的背面（新编页码142页）。第七页最前面的一首诗，是俞烈的诗，可以参考明贤志第六十八页的背面。其他缺的部分，也可以参考明贤志第六十四页到九十三页（141-200页）。③ 第十页缺：第九页最后一首诗是茅溱的《集鹤林寺》，可以参考明贤志第八十四页的正面。其他缺的部分，也请参考明贤志。④ 第十八页缺：这一页是《黑漆光菩萨传》的后半部分，明贤志里没有这篇传记。第十九页开头两行之前的内容，可以参考明贤志第七页正面的“朱元章墓”那条记载。⑤ 现存的本子只到第二十八页为止，后面应该还有缺页，所以这里留了两面空白页，等以后找到再补。⑥ 现存的本子里有陶望龄《鹤林寺画祖师像记》的残页，放在最后。缺的文字，可以参考明贤志第四十七、四十八页（107-109页）。另外，这个现存的版本字迹已经非常模糊了，可以用明贤志对照着看。这个志书里收录的文字和明贤志有些地方不一样，记载的文献也有些是明贤志里没有的，所以虽然是个残本，还是把它收录进来，好和明贤志互相参照。