第三明宗者，修行之喉衿，顯體之要蹊。如梁柱持屋，結網綱維。提維則目動，梁安則桷存。葢因果之宗，是一經顯體之要也。今略錄其三：初簡宗體，二正明宗，三眾經同異。
初、簡宗體者，有人言：宗即是體，體即是宗。今所不用。何者？宗致既是因果，因果即二；體非因果，體即不二。體若是二，體即非體；體若不二，體即非宗；宗若不二，宗即非宗；宗若是二，宗即非體。云何而言體即是宗，宗即是體？又柱梁是屋之綱維，屋空是梁柱所取，不應以梁柱是屋空，屋空是梁柱。宗體若一，其過如是。又宗體異者，則二法孤調，宗非顯體之宗，體非宗家之體。宗非顯體之宗，宗則邪倒無印；體非宗家之體，則體狹不周。離法性外，別有因果。宗體若異，其過如是。今言不異而異，約非因非果而論因果，故有宗體之別耳。釋論云：若離諸法實相，皆名魔事。普賢觀云：大乘因者，諸法實相；大乘果者，諸法實相。即其義也。當知實相體通而非因果，行始辨因，行終論果耳。
二、正明宗者，此經始從序品訖安樂行品，破廢方便，開顯真實佛之知見，亦明弟子實因實果，亦明師門權因權果。文義雖廣，撮其樞要，為成弟子實因，因正果傍，故於前段明迹因迹果也。從涌出品訖勸發品，廢迹顯本，廢方便之近壽，明長遠之實果，亦明弟子實因實果，亦明師門權因權果。文義雖廣，撮其樞要，為顯師之實果，果正因傍，故於後段明本因本果。合前因果，共為經宗，意在於此。所以經分二文，論本論迹，雙題法譬，舉蓮舉華，師弟權實，總在其間也。
三眾經因果同異者，謂迹因果或同或異，本因果永異。迹因果者，實相通印諸體，何經不約此以論因果？大品明非因非果實相為體，而但因為宗，般若遣蕩正是因意，故云菩薩心中名般若，在佛心中名薩婆若。文中亦說菩薩無生滅因，獲不斷不常薩婆若果。叡師序云：啟玄章以不住為始，歸三慧以無得為終，終始因果也。文中亦說一切種智佛果為成般若之因，因正果傍無量義宣說摩訶般若歷劫修行，故知彼經用因為宗也。淨名用佛國因果兩義為宗，寶積具問因果，佛備答因果，故知雙用因果為宗也。華嚴圓頓之教解宗不同，或言用因為宗，據題言華嚴是萬行莊飾修因之義，文中說四十地行相，故用因為宗。又云果為宗，據題云大方廣佛，佛是極果之名，華嚴是定慧萬善莊嚴佛身非莊嚴因，文中多說舍那法身之事，即用果為宗也。又解云：因果合為宗，如言佛即是果，華嚴即是因，文中具說法身亦說諸地，俱用因果為宗。諸經對緣不同，故明宗互異耳。般若通對三人，傍真因果此義則異，別對菩薩復有利鈍，為鈍明因此義亦異，利人因者此義則同。淨名佛國義兼，若三種佛國因果此義則異，一種佛國因果者則同。華嚴亦對兩緣，鈍異利同如前分別。又將此意歷五味因果例可知，是為眾經因果與迹門同異之相也。二、本門因果永異眾經者，若三藏菩薩始行實因果無權因果，乃至明佛道樹始成非久遠本迹，通教菩薩亦始行因神通變化而論本迹，非久遠本迹也。大品說菩薩有本迹，二乘則無，說佛始得生法二身本迹不說久遠。淨名不說聲聞有本迹，但明菩薩住不思議之本迹，說佛有淨土螺髻所見亦非久遠。華嚴說舍那釋迦為本迹，菩薩亦有本迹，聲聞尚不聞不解，云何自有本迹？今經發聲聞有本、本有因果，示為二乘迹中因果發佛之迹，王宮生身生、道樹法身生，乃至中間生法二身悉皆是迹，但取最初先得真應名之為本，故師弟本因本果與餘經永異。今經迹中師弟因果與眾經有同有異，本中師弟因果眾經所無，正以此之因果為經玅宗也。