如是我闻：
我亲自听佛这样说过：
一时婆伽婆游行人间，至毘舍离国住乐音树下，与大比丘众八千人俱，菩萨三万六千、国王、大臣、婆罗门、居士、天、龙、阿修罗、揵达婆、伽楼茶、紧那罗、摩呼罗伽等，大众围绕于前说法。
一时，佛陀在人间游化，来到毗舍离国，住在乐音树下。有八千大比丘众、三万六千菩萨，以及国王、大臣、婆罗门、居士、天神、龙神、阿修罗、乾达婆、迦楼罗、紧那罗、摩睺罗伽等大众围绕在前，听佛说法。
尔时，曼殊室利法王子，承佛威神，即从座起，偏露一髆，右膝着地，向婆伽婆合掌曲躬，白言：「世尊！唯愿演说诸佛名号及本昔所发殊胜大愿，令众生闻已业障消除，摄受来世正法坏时诸众生故。」
那时，文殊师利菩萨承蒙佛陀威神加持，从座位上起身，袒露右肩，右膝跪地，向世尊合掌恭敬行礼，说道：世尊啊！恳请您宣说诸佛名号及往昔所发殊胜大愿，让众生听闻后能消除业障，也是为了护持将来正法衰微时的众生。
尔时，婆伽婆赞曼殊室利童子言：「善哉！善哉！曼殊室利大慈悲者，起无量悲，劝请我说，为欲义利种种业障所缠众生，饶益安乐诸天人故。曼殊室利！当善忆念，听我所说。」
这时，世尊赞叹文殊师利童子说：善哉善哉！文殊师利你真是大慈大悲，发起无量悲心，劝请我宣说佛法，是为了利益那些被种种业障缠缚的众生，使诸天世人获得安乐。文殊师利！你要好好记住，仔细听我宣说。
时曼殊室利童子，乐听佛说，白言：「唯然，世尊！」
这时文殊师利童子，欢喜听闻佛陀说法，便说道：是的，世尊！
佛告曼殊室利：「东方过此佛土十恒河沙等佛土之外，有世界名净琉璃，彼土有佛，名：药师琉璃光如来、应、正遍知、明行足、善逝、世间解、无上士、调御丈夫、天人师、佛世尊。
佛告诉文殊师利菩萨：向东方经过十个恒河沙数量的佛土那么远的地方，有一个叫净琉璃的世界。那里有一位佛，名号为：药师琉璃光如来、应供、正等正觉、明行圆满、善逝、世间解、无上士、调御丈夫、天人师、佛世尊。
「曼殊室利！彼世尊药师琉璃光如来本行菩萨行时，发十二大愿。何者十二？
曼殊室利！那位世尊药师琉璃光如来在修行菩萨道时，曾发下十二大愿。是哪十二大愿呢？
「第一大愿：愿我来世于佛菩提得正觉时，自身光明炽然，照曜无量无数无边世界，三十二丈夫大相及八十小好以为庄严；我身既尔，令一切众生如我无异。
第一大愿：愿我来世成就佛道时，自身光明炽盛，照耀无量无边世界，具足三十二大丈夫相和八十种随形好作为庄严；我的身体如此，也要让一切众生都和我一样。
「第二大愿：愿我来世得菩提时，身如琉璃，内外清净无复瑕垢，光明旷大威德炽然；身善安住，焰网庄严过于日月。若有众生生世界之间，或复人中昏暗及夜莫知方所，以我光故，随意所趣作诸事业。
第二大愿：愿我来世成佛时，身体如同琉璃般内外明澈，毫无瑕疵污秽，光明广大，威德炽盛；此身安稳庄严，光芒交织胜过日月。若有众生身处世间，或在人间处于黑暗迷茫不知方向之时，凭我光明威德，皆能随心所欲成就诸事。
「第三大愿：愿我来世得菩提时，以无边无限智慧方便，令无量众生界受用无尽，莫令一人有所少乏。
第三大愿：愿我来世证得菩提时，以无边无量的智慧方便，让无量众生都得到无尽的受用，不让任何一人有所匮乏。
「第四大愿：愿我来世得菩提时，诸有众生行异道者，一切安立菩提道中，行声闻道、行辟支佛道者，皆以大乘而安立之。
第四大愿：愿我来世成佛时，所有修行外道的众生，都能安住于菩提正道；那些修习声闻道、辟支佛道的修行者，都能以大乘佛法引导他们获得究竟解脱。
「第五大愿：愿我来世得菩提时，若有众生于我法中修行梵行，此诸众生无量无边，一切皆得不缺减戒，具三聚戒，无有破戒趣恶道者。
第五大愿：愿我来世成佛时，若有众生在我教法中修习清净梵行，这些众生无量无边，都能得到圆满无缺的戒律，具足三聚净戒，没有一个因为破戒而堕入恶道的。
「第六大愿：愿我来世得菩提时，若有众生其身下劣，诸根不具、丑陋顽愚、聋盲跛躄、身挛背伛、白癞癫狂，若复有余种种身病，闻我名已，一切皆得诸根具足、身分成满。
第六大愿：愿我来世成佛时，若有众生身体残缺不全，五官不健全，相貌丑陋，愚钝无知，耳聋眼瞎，瘸腿驼背，患有皮肤病或精神失常，以及其他各种身体疾病，听闻我的名号后，都能获得健全的身体，肢体完整健康。
「第七大愿：愿我来世得菩提时，若有众生诸患逼切，无护无依无有住处，远离一切资生医药，又无亲属，贫穷可愍，此人若得闻我名号，众患悉除无诸痛恼，乃至究竟无上菩提。
第七大愿：愿我来世成佛时，若有众生被各种病苦逼迫，无人保护、无依无靠、无处安身，缺乏生活所需和医药，又没有亲人，贫穷可怜。这样的人若能听闻我的名号，所有病苦都能消除，不再有各种疼痛烦恼，直至最终成就无上菩提。
「第八大愿：愿我来世得菩提时，若有女人为妇人百恶所逼恼故，厌离女身，愿舍女形，闻我名已，转女人身成丈夫相，乃至究竟无上菩提。
第八大愿：愿我来世证得无上正觉时，若有女人因遭受种种妇人之苦而厌弃女身，发愿舍弃女性形貌，听闻我的名号后，即能转女身为男子相，直至成就无上菩提。
「第九大愿：愿我来世得菩提时，令一切众生解脱魔网，若堕种种异见稠林，悉当安立置于正见，次第示以菩萨行门。
第九大愿：愿我来世成佛时，让所有众生都能摆脱魔网的束缚，如果陷入各种邪见密林，我都要帮助他们树立正见，并循序渐进地教导他们菩萨修行的方法。
「第十大愿：愿我来世得菩提时，若有众生种种王法系缚鞭挞，牢狱应死，无量灾难，悲忧煎迫，身心受苦，此等众生，以我福力，皆得解脱一切苦恼。
第十大愿：愿我来世成佛时，若有众生被各种刑罚捆绑鞭打，关押在监狱面临死刑，遭受无数灾祸苦难，悲痛忧愁煎熬逼迫，身心都在受苦，这些众生凭借我的福德力量，都能解脱一切烦恼痛苦。
「十一大愿：愿我来世得菩提时，若有众生饥火烧身，为求食故作诸恶业，我于彼所，先以最妙色香味食饱足其身，后以法味毕竟安乐而建立之。
第十一大愿：愿我来世成佛时，若有众生被饥饿煎熬，为求食物而造作恶业，我将在他们面前，先用最美妙的色香味俱全的食物让他们饱足身体，再用佛法真味使他们获得究竟安乐。
「十二大愿：愿我来世得菩提时，若有众生贫无衣服，寒热蚊虻日夜逼恼，我当施彼随用衣服，种种杂色如其所好，亦以一切宝庄严具、花鬘涂香、鼓乐众伎，随诸众生所须之具，皆令满足。
十二大愿：愿我来世成佛时，若有众生贫穷无衣，受寒暑蚊虫日夜折磨，我必布施给他们合身的衣物，各式颜色随其所爱，并以一切珍宝装饰品、花环香料、鼓乐歌舞等，凡是众生所需之物，全都使其得到满足。
「此十二大愿，是彼世尊药师琉璃光如来、应、正遍知，行菩萨时，本昔所作。
这十二大愿，是世尊药师琉璃光如来、应供、正等觉在行菩萨道时，往昔所发下的。
「复次，曼殊室利！药师琉璃光如来所有诸愿，及彼佛土功德庄严，乃至穷劫说不可尽。彼佛国土一向清净，无女人形，离诸欲恶，亦无一切恶道苦声，琉璃为地，城阙、垣墙、门窓、堂阁、柱梁、斗拱、周匝罗网，皆七宝成，如极乐国，净琉璃界庄严如是。
再者，文殊师利！药师琉璃光如来所发的一切大愿，以及其佛国净土的无量功德庄严，即使穷尽劫数也难以说完。那个佛国永远清净无染，没有女身之相，远离各种欲望和恶业，也听不到任何恶道受苦的声音。大地由琉璃铺就，城池、楼台、围墙、门窗、殿堂、梁柱、斗拱，四周环绕的罗网，全都由七种珍宝构成。如同极乐世界一般，药师佛的净琉璃世界就是如此庄严殊胜。
「于其国中有二菩萨摩诃萨，一名日光，二名月光，于彼无量无数诸菩萨众，最为上首，持彼世尊药师琉璃光如来正法之藏。
在那个佛国中有两位大菩萨，一位名叫日光，一位名叫月光，在无量无数的菩萨众中位居上首，他们护持着世尊药师琉璃光如来的正法宝藏。
「是故，曼殊室利！信心善男子、善女人，应当愿生彼佛国土。」
因此，文殊师利，凡是具备信心的善男子、善女人们，都应当发愿往生到阿弥陀佛的净土。
尔时，世尊复告曼殊室利童子言：「曼殊室利！或有众生不识善恶、多贪无厌，不知布施及施果报，愚痴无智阙于信根，聚财护惜不欲分施。此等众生无施心故，见乞者来，其心不喜，如割身肉。复有无量悭贪众生，自不受用，亦不欲与父母、妻子，况奴婢、作使及余乞人。此等众生，人间命终生饿鬼道或畜生道。由昔人间，曾得闻彼药师琉璃光如来名号故，或在鬼道或畜生道，如来名号暂得现前，即于念时，彼处命终，还生人道，得宿命智，怖畏恶趣，不乐欲乐，好行慧施，赞叹施者，一切所有悉能舍施，渐以头目、手足、血肉、身分皆与求者，况余财物。
那时，世尊又告诉文殊师利童子说：文殊师利！有些众生不能辨别善恶，贪得无厌，不懂得布施及布施的果报，愚昧无知缺乏信心，积聚财物吝啬守护，不愿施舍。这些众生因为没有布施心，见到乞求者前来，心中不欢喜，如同割自身肉般痛苦。还有无量悭吝贪婪的众生，自己不肯享用，也不愿给予父母妻儿，何况奴婢佣工及其他乞讨之人。这些众生在人世命终后将投生饿鬼道或畜生道。由于往昔在人间曾听闻药师琉璃光如来名号的缘故，即使投生在鬼道或畜生道，如来名号忽然现前，就在忆念的当下，便能从恶道命终，重新投生人道，获得宿命智慧，畏惧恶道苦报，不再贪著欲乐，乐于行善布施，赞叹施舍者，能舍尽所有财物，渐渐连头目手足血肉身体都能施与求取者，何况其余财物。
「复次，曼殊室利！有诸众生，虽奉如来受持学句，然破戒、破行、破于正见；或受学句、护持禁戒，然不求多闻，不解如来所说修多罗中甚深之义；或复多闻，而增上慢自是非他，嫌谤正法为魔伴党。此等痴人，及余无量百千俱胝那由他众生，行邪道者，当堕地狱。此等众生，应于地狱流转无期，以得闻彼世尊药师琉璃光如来名号故，于地狱处，彼佛威力，如来名号暂得现前，即时舍命，还生人道，正见精进，淳善净心，便能舍家，于如来教中出家学道，渐次修行菩萨诸行。
再者，曼殊室利！有些众生虽然信奉如来并受持戒律，却破坏戒律、败坏修行、背离正见；或者虽然受持戒律、严守禁戒，但不追求广学多闻，不能理解如来在经典中所说的深奥义理；或者虽然博学多闻，却因傲慢自大而自是非他，诽谤正法，成为魔的同伴。这些愚痴之人，以及其他无量百千万亿众生中走上邪道者，都将堕入地狱。这些众生本应在地狱中长久轮回，但由于听闻了世尊药师琉璃光如来的名号，在地狱中凭借彼佛的威力和如来名号的加持，短暂显现佛力，便能即刻舍离恶道之身，重新投生为人，具足正见，精进修行，心地纯善清净，最终能够舍弃世俗家庭，在如来的教法中出家修道，循序渐进地修习菩萨的种种行持。
「复次，曼殊室利！或有众生以妬忌故，但自称赞不赞他人。此诸众生以自高轻他故，于三恶道，无量千岁受诸苦毒；过无量千岁已，于彼命终，生畜生趣，作牛马驼驴，鞭杖捶击，饥渴逼恼，身负重担，随路而行；若生人道，常居下贱，为人奴婢，受他驱役。若昔人中，闻彼世尊药师琉璃光如来名号者，以此善根，众苦解脱，诸根猛利，聪慧博识，恒求善本，得与良友常相随逐，能断魔羂，破无明㲉，竭烦恼河，解脱一切生老病死忧悲苦恼。
再有，文殊师利！或有众生因嫉妒心，只知称赞自己而不肯赞美他人。这类众生由于自高自大轻视他人，将在三恶道中经历无量千年的痛苦折磨；历经无量千岁后命终，转生畜生道，成为牛马骆驼驴等，遭受鞭打捶击，饥渴逼迫，身负重担，沿路跋涉；若得投生人道，也常处卑贱，为人奴婢，受人驱使。若这些众生曾在人世听闻药师琉璃光如来名号，以此善根，便能解脱众苦，诸根聪利，智慧广博，常求善法，得遇善友常相随行，能断魔网，破无明壳，枯竭烦恼之河，解脱一切生老病死忧悲苦恼。
「复次，曼殊室利！有诸众生好喜乖离更相鬪讼，此等互起恶心众生，身口及意恒作诸恶，为欲相损，各各常以无益相加，或告林神、树神、山神、冢神种种别神，杀诸畜生，取其血肉，祭祀一切夜叉、罗刹食血肉者，书怨人字，并作其形，成就种种毒害、呪术、厌魅、蛊道、起尸鬼呪，欲断彼命及坏其身。由闻世尊药师琉璃光如来名号故，此诸恶事不能伤损，皆得互起慈心、益心、无嫌恨心，各各欢悦，更相摄受。
再有，文殊师利，有些众生喜欢挑拨离间，互相争斗诉讼。这些彼此怀着恶意的众生，身口意三业常造恶行，为了损害对方，经常互相施加无益之事。他们或向林神、树神、山神、冢神等各类神灵告状，杀害各种牲畜，取其血肉祭祀那些食血肉的夜叉罗刹；书写仇人名字，制作仇人形象，施行种种毒害、咒术、厌魅、蛊道、起尸鬼咒等邪法，想要断送对方性命、毁坏对方身体。但由于听闻了世尊药师琉璃光如来的名号，所有这些恶事都不能造成伤害。他们都能相互生起慈爱心、利益心、无怨恨心，彼此欢喜愉悦，互相包容接纳。
「复次，曼殊室利！此诸四众——比丘、比丘尼、优婆塞、优婆私——及余信心善男子、善女人等，受八分斋，或复一年、或复三月，受持诸戒，以此善根，随所憙乐，随所愿求，若欲往生西方极乐世界阿弥陀如来所者，由得闻彼世尊药师琉璃光如来名号故，于命终时，有八菩萨乘空而来，示其道径，即于彼界种种异色波头摩华中，自然化生；若复此人欲生天上，即得往生，本昔善根无有穷尽，不复更生诸余恶趣，天上命尽，当生人间，为转轮王，四洲自在，安立无量百千俱胝那由他众生于十善业道，或复生于刹利大族、婆罗门大族、居士大家，金银、粟帛、仓库盈满，形色具足、自在具足、眷属具足，勇健多力如大力士；若有女人得闻说此如来名号，至心受持，此人于后永离女身。」
再者，文殊师利！这些四众弟子——比丘、比丘尼、优婆塞、优婆夷——以及其他怀着虔诚心的善男子、善女人们，若能受持八关斋戒，或一年、或三月，守持种种戒律，凭借这些善根，随其心中所好，随其心中所求，若有人想往生西方极乐世界阿弥陀如来处，由于听闻过药师琉璃光如来的名号，在命终之时，将有八位菩萨乘空而来，为他指引道路，使其在极乐世界各种颜色的莲花中自然化生；若有人愿生天上，也能如愿往生，往昔积累的善根永不耗尽，不再堕入恶道，天福享尽后，将投生人间成为转轮圣王，统领四洲，能令无量百千亿众生安住于十善业道；或者投生为剎帝利大族、婆罗门大族、居士大姓之家，金银财宝、粮食布匹充满仓库，相貌端严、生活富足、眷属圆满，体魄强健如大力士；若有女人听闻药师如来名号，至诚受持，此后永离女身。
尔时，曼殊室利童子白佛言：「世尊！我于后时，以彼世尊药师琉璃光如来名号，于信心善男子、善女人所，种种方便流布令闻，乃至睡中亦以佛名觉寤其耳。若受持此经读诵宣说，或复为他分别开解，若自书，若令人书，若取经卷五色净彩以盛裹之，洒扫净处以安置之，持种种华、种种香、涂香、华鬘、宝幢、幡盖而用供养，尔时，四大天王与其眷属，并余百千俱胝那由他诸天，皆诣其所。若此经卷流行之处，若复有人诵持此经，以得闻彼世尊药师琉璃光如来名号，及本昔所发殊胜大愿故，当知是处无复横死，亦复不为诸鬼所持夺其魂魄，设已夺者，还复如故。」
这时，文殊师利童子恭敬地向佛陀禀告：世尊！我将在未来时期，以药师琉璃光如来的名号，用各种善巧方便让有信心的善男子、善女子听闻此名号，甚至在睡梦中也会用佛号唤醒他们的耳朵。如果有人受持读诵这部经典，或为他人解说经义；自己抄写或请人抄写经卷；用五色净布包裹经书，打扫清净处所安置经卷；以各种鲜花、香料、涂香、花鬘、宝幢、幡盖等供养经典。这时，四大天王及其眷属，以及无量诸天都会来到此处。凡是这部经典流通的地方，如果有人诵读受持此经，听闻药师琉璃光如来名号及其往昔所发殊胜大愿，应当知道此处不会有人横死，也不会被恶鬼夺走魂魄；即使已被夺走的，也能恢复如初。
佛言：「如是，如是！曼殊室利！如汝所说。曼殊室利！信心善男子、善女人，若欲供养彼如来者，此人应作如来形像，七日七夜受八分斋食清净食，于清净处散种种华，烧种种香，以种种缯彩，种种幡幢，庄严其处，澡浴清洁，着新净衣，应生无垢浊心，无怒害心，于一切众生起利益心，慈悲喜舍平等之心，鼓乐歌赞，右绕佛像，应念彼如来本昔大愿并解释此经，如所思念，如所愿求，一切所欲，皆得圆满——求长寿得长寿，求福报得福报，求自在得自在，求男女得男女。
佛说：正是如此，正是如此！文殊师利！正如你所说。文殊师利！若有信心的善男子、善女人，想要供养那位如来，此人应当塑造如来形像，七日七夜受持八关斋戒，食用清净食物，在清净之处散各种鲜花，焚烧各种香料，用各种彩色丝绸、种种幡幢庄严道场，沐浴清洁，穿着崭新干净衣服，应当生起无垢染心、无嗔害心，对一切众生生起利益心，怀着慈悲喜舍的平等心，奏乐歌赞，向右绕佛像而行，应当忆念那位如来往昔所发大愿并解说此经，如此忆念，如此祈求，一切愿望都能圆满实现——求长寿得长寿，求福报得福报，求自在得自在，求子女得子女。
「或复有人忽得恶梦，或见诸恶相，或怪鸟来集，于其住所百怪出现，此人若能以种种众具，供养恭敬彼药师琉璃光如来者，一切恶梦、恶相、不吉祥事皆悉隐没，或有水怖、火怖、刀怖、毒怖、悬崄之怖，恶象、师子、虎狼、熊罴、毒蛇、恶蝎、蜈蚣、蚰蜒如是等怖，忆念供养彼如来者，一切怖畏皆得解脱。若他国侵扰、贼盗反乱、如是等怖，亦应念彼如来恭敬尊重。
如果有人做了噩梦，或见到不祥的景象，或怪鸟聚集，住所出现各种怪异现象，这人若能以各种供品恭敬供养药师琉璃光如来，那么一切噩梦、凶兆和不吉利的事都会消失。无论是水灾、火灾、刀兵之灾、毒害之灾、坠崖之灾，还是恶象、狮子、虎狼、熊罴、毒蛇、蝎子、蜈蚣、蚰蜒等带来的恐惧，只要忆念供养这位如来，一切恐怖都能解脱。若是遭遇他国侵扰、盗贼叛乱等灾祸，也应当忆念这位如来，恭敬礼拜。
「复次，曼殊室利！若有信心善男子、善女人，乃至尽形受三归依，不事余天，或持五戒，或持十戒，或持菩萨一百四戒，或复出家受持比丘二百五十戒，若比丘尼受持五百戒，于随所受中，毁犯禁戒，畏堕恶道，若能供养彼世尊药师琉璃光如来者，决定不受三恶道报。或有女人临当产时，受于极苦，若能称名供养彼世尊药师琉璃光如来者，速得解脱，所生之子身分具足，形色端正，见者欢喜，利根聪明，安隐少病，无有非人夺其魂魄。」
另外，文殊师利啊！若有虔诚的善男子、善女人，甚至终身皈依三宝，不供奉其他天神，或持守五戒，或持守十戒，或持守菩萨一百四戒，或是出家受持比丘二百五十戒，若是比丘尼受持五百戒，在所持戒律中，万一违犯戒条，畏惧堕入恶道，若能供养那位世尊药师琉璃光如来，必定不会遭受三恶道的报应。若有妇人临产时遭受极大痛苦，若能称念那位世尊药师琉璃光如来的名号并虔诚供养，便能迅速获得解脱，所生的孩子身体健康，相貌端正，见到的人都心生欢喜，天资聪颖，平安少病，不会有非人夺走孩子的魂魄。
尔时，世尊告慧命阿难言：「阿难！如我称扬彼世尊药师琉璃光如来所有功德，汝信受耶？汝于如是诸佛如来甚深境界多生疑惑。」
那时，世尊对慧命阿难说：阿难，当我赞叹药师琉璃光如来的所有功德时，你是否能够深信接受？你对于这些如来甚深微妙的境界，常常会产生疑惑。
时，慧命阿难白佛言：「大德世尊！我于如来所说法中，无复疑惑。何以故？一切如来身口意行无不清净。世尊！此日月有如是大神通、有如是大威力，可令堕落，须弥山王可得移动，诸佛所言无有差异。大德世尊！或有众生信根不具，闻说如来佛境界已，作是思惟：『云何但念彼如来名获尔许功德？』心不信受，生于诽谤，此等长夜无义饶益，当堕苦趣。」
这时，智慧深广的阿难尊者恭敬地对佛陀说：大德世尊！我对如来所说的教法已不再有任何疑惑。为什么呢？因为一切如来的身口意三业都是究竟清净的。世尊！即使日月有大神通力、大威德力可以坠落，须弥山王可以被移动，诸佛所说的教法也始终不会改变。大德世尊！但有些众生信根尚未具足，听闻如来佛境界的殊胜功德后，心中这样想：为何仅仅称念佛名就能获得如此殊胜功德？他们不能信受，甚至生起诽谤之心。这样的人长夜沉沦于无义利中，将来必堕恶趣受苦。
佛言：「阿难！若彼如来所有名号入其耳中，此人堕恶道者，无有是处。阿难！诸佛境界诚为难信，汝今信受，应知皆是如来威力，非一切声闻、辟支佛地所能信受，唯除一生补处菩萨摩诃萨。阿难！人身难得，于三宝中信敬尊重亦难可得，闻彼如来名号倍难于此。阿难！彼世尊药师琉璃光如来无量菩萨行，无量诸巧便，无量旷大愿，我欲一劫若过一劫说彼如来菩萨行愿，乃至穷劫，彼世尊药师琉璃光如来本昔所行及殊胜大愿，亦不究尽。」
佛说：阿难！如果有人听闻药师如来的名号，此人若堕入恶道，绝无可能。阿难！诸佛的境界确实难以令人相信，你现在能够信受，应当知道这都是如来的威神力所致，不是一切声闻、辟支佛所能信受的，除了一生补处的菩萨摩诃萨。阿难！人身难得，对佛法僧三宝生起信心、恭敬尊重也很难得，而听闻药师如来的名号比这更加难得。阿难！那位世尊药师琉璃光如来，具有无量的菩萨修行、无量的善巧方便、无量的广大誓愿。即使我用一劫或超过一劫的时间，来宣说这位如来的菩萨行愿，乃至穷尽劫数，也说不尽世尊药师琉璃光如来往昔所修行的功德和殊胜的大愿。
尔时，众中有菩萨摩诃萨名曰救脱，即从座起，偏露一髆，右膝着地，向婆伽婆合掌曲躬白言：「大德世尊！于未来世，当有众生身婴重病，长患羸瘦不食饥渴，喉唇干燥，死相现前，目无所见，父母、亲眷、朋友、知识啼泣围绕，其人尸形卧在本处，阎摩使人引其神识，置于阎摩法王之前，此人背后有同生神，随其所作，若罪若福一切皆书，尽持授与阎摩法王。时阎摩法王推问其人，算计所作，随善随恶而处分之。若能为此病人归依彼世尊药师琉璃光如来，如法供养，即得还复。此人神识得回还时，如从梦觉皆自忆知，或经七日、或二十一日、或三十五日、或四十九日，神识还已，具忆所有善恶业报，由自证故，乃至失命不造恶业。是故信心善男子、善女人，应当供养药师如来。」
那时，法会中有一位名叫救脱的大菩萨，从座位上起身，袒露右肩，右膝跪地，双手合十恭敬地向世尊禀告：大德世尊！未来之世将会有众生身患重病，长期虚弱消瘦，无法进食饮水，喉咙嘴唇干裂，显现死亡征兆，眼睛失去光明。父母、亲属、朋友围绕在侧悲泣。当此人遗体躺在原处时，阎罗王的使者会将其神识引至阎罗法王面前。此人身后有位同生神，将其生前所作善恶全部记录下来，呈交给阎罗法王。阎罗法王便会审问此人，计算其行为，根据善恶予以裁决。若能为此病人皈依药师琉璃光如来，如法供养，便能得救。当此人神识返回时，如同从梦中醒来，能清楚回忆经历，或七日、或二十一日、或三十五日、或四十九日后神识完全恢复，能清楚记得所有善恶业报。因亲身体验之故，乃至失去性命也不再造恶业。因此有信心的善男子、善女人，都应当供养药师如来。
尔时，慧命阿难问救脱菩萨言：「善男子！应云何供养彼世尊药师琉璃光如来也？」
那时，慧命阿难向救脱菩萨问道：善男子！应当如何供养那位世尊药师琉璃光如来呢？
救脱菩萨言：「大德阿难！若有患人欲脱重病，当为此人七日七夜受八分斋，当以饮食及种种众具，随力所办供养比丘僧，昼夜六时礼拜供养彼世尊药师琉璃光如来，四十九遍读诵此经，然四十九灯，应造七躯彼如来像，一一像前各置七灯，一一灯量大如车轮，或复乃至四十九日光明不绝，当造五色彩幡长四十九尺。
救脱菩萨说：阿难尊者！如果有病人想要摆脱重病，应当为这个人在七天七夜里持守八关斋戒，要用饮食和各种用品，尽自己所能供养比丘僧众，白天黑夜六个时辰礼拜供养药师琉璃光如来，诵读这部经四十九遍，点燃四十九盏灯，要塑造七尊药师如来像，每尊像前各放置七盏灯，每盏灯的灯焰要像车轮那么大，或者连续四十九天不让灯光熄灭，还要制作五色彩幡，幡长四十九尺。
「复次，大德阿难！灌顶刹利王等，若灾难起时——所谓人民疾疫难、他方侵逼难、自界反逆难、星宿变怪难、日月薄蚀难、非时风雨难、过时不雨难——尔时，此灌顶刹利王，当于一切众生起慈愍心，赦诸系闭，依前所说供养法式，供养彼世尊药师琉璃光如来。时灌顶刹利王用此善根，由彼世尊药师琉璃光如来本昔胜愿故，其王境界即得安隐，风雨以时、禾稼成就、国土丰熟，一切国界所有众生，无病安乐，多生欢喜，于其国界亦无夜叉、罗刹、毘舍阇等诸恶鬼神扰乱众生，所有恶相皆即不现，彼灌顶刹利王，寿命色力无病自在并得增益。」
再者，大德阿难！受灌顶的转轮圣王等，若遇灾祸现前时——诸如百姓瘟疫流行之灾、外敌侵犯逼迫之灾、境内叛乱反逆之灾、星象异常变动之灾、日月亏蚀昏暗之灾、非时狂风暴雨之灾、久旱不雨饥馑之灾——此时，这位受灌顶的圣王应当对一切众生发起慈悯之心，赦免狱中囚徒，依照前述供养仪轨，虔诚供养药师琉璃光如来。那时圣王以此善根功德，仰仗药师如来往昔殊胜本愿力故，其国土当即获得安宁，风雨调顺时节和畅，五谷丰登仓廪充实，举国百姓无病无灾，心生无量欢喜安乐。其疆域内再无夜叉、罗刹、毗舍阇等恶鬼神扰乱众生，所有凶险灾兆自然隐没。这位受灌顶的圣王，更能增益寿命、增强体魄、免除病苦、得大自在。
尔时，慧命阿难问救脱菩萨言：「善男子！云何已尽之命而可更延？」
这时，慧命阿难向救脱菩萨问道：善男子，为何已经终结的生命还能延续？
救脱菩萨言：「阿难！汝岂不闻如来所说九横死耶？是故教以呪药方便；或有众生，得病非重，然无医药及看病人，或复医人疗治失所，非时而死，是为初横；第二横者，王法所杀；第三横者，游猎、放逸、婬醉无度，为诸非人害其魂魄；第四横者，为火所烧；第五横者，为水所溺；第六横者，入师子、虎豹、诸恶兽中；第七横者，饥渴所困，不得饮食，因此致死；第八横者，厌祷、毒药、起尸鬼等之所损害；第九横者，投岩取死，是名如来略说大横有此九种，其余复有无量诸横。」
救脱菩萨说：阿难，你难道没听过如来所说的九种横死吗？所以我才教授咒药救度之法。有些众生患病不重，却因缺医少药、无人照料，或遇庸医误治而枉死，这是第一种横死。第二种是被王法处死；第三种是因游猎放逸、纵欲醉酒无度，被非人夺其魂魄；第四种是被火烧死；第五种是溺水而亡；第六种是误入狮虎猛兽之口；第七种是因饥渴困顿，不得饮食而死；第八种是遭巫蛊毒药、起尸鬼怪所害；第九种是跳崖自尽。这就是如来略说的九大横死，此外还有无量诸般横死。
尔时，众中有十二夜叉大将，俱在会坐，所谓：
这时，法会中有十二位夜叉大将也在座中，他们分别是：
宫毘罗大将、 跋折罗大将、
迷佉罗大将、 安捺罗大将、
安怛罗大将、 摩涅罗大将、
因陀罗大将、 波异罗大将、
摩呼罗大将、 真达罗大将、
招度罗大将、 鼻羯罗大将，
宫毗罗大将、跋折罗大将、 迷佉罗大将、安捺罗大将、 安怛罗大将、摩涅罗大将、 因陀罗大将、波异罗大将、 摩呼罗大将、真达罗大将、 招度罗大将、鼻羯罗大将。
此等十二夜叉大将，一一各有七千夜叉以为眷属，皆同一声白世尊言：「我等今者蒙佛威力，得闻世尊药师琉璃光如来名号已，不复更有恶道之怖。我今相与皆同一心，乃至寿尽归依佛、归依法、归依僧，皆当荷负一切众生，为作义利，饶益安乐，随于何等村城聚落阿兰拏处，若流布此经，若复持彼世尊药师琉璃光如来名号，亲近供养者，我等眷属卫护是人，皆使解脱一切苦难，诸有所求，悉令满足。」
这十二位夜叉大将，每一位各有七千夜叉眷属，齐声向世尊禀告：如今我们蒙受佛陀威神力，听闻世尊药师琉璃光如来名号后，不再畏惧堕入恶道。从今以后，我们将同心协力，直至生命终结，都归依佛、归依法、归依僧，承担护持一切众生的责任，为他们谋求利益，给予安乐。无论在村庄、城市、聚落或寂静处，凡是流通此经，或持诵世尊药师琉璃光如来名号、亲近供养的人，我们这些眷属都会守护他们，使其解脱一切苦难，凡有所求，皆令满足。
尔时，世尊赞诸夜叉大将言：「善哉，善哉！大夜叉将！汝等若念彼世尊药师琉璃光如来恩德者，当念饶益一切众生。」
这时，世尊称赞诸位夜叉大将说：很好，很好！大夜叉将领们！你们若是感念那位世尊药师琉璃光如来的恩德，就应当想着利益一切众生。
尔时，慧命阿难白佛言：「世尊！此经何名？云何奉持？」
这时，智慧第一的阿难尊者向佛陀请教：世尊，这部经叫什么名字？我们应当如何受持奉行？
佛言：「阿难！此法门者，名为『药师琉璃光如来本昔所发殊胜大愿』，当如是持；名为『十二夜叉大将自誓』，当如是持；名为『净一切业障』，当如是持。」
佛陀说：阿难！这个法门，名为药师琉璃光如来往昔所发殊胜大愿，应当这样受持；名为十二夜叉大将自誓，应当这样受持；名为净除一切业障，应当这样受持。
时婆伽婆说是语已，诸菩萨摩诃萨、诸大声闻、国王、大臣、婆罗门、居士，及一切大众阿修罗、揵达婆等，闻佛所说，欢喜奉行。
当时世尊说完这些话后，各位大菩萨、大阿罗汉、国王、大臣、婆罗门、居士，以及所有在场的阿修罗、乾闼婆等大众，听闻佛陀的教诲，都欢喜地信受奉行。