莲池大师将经文分为序分、正宗分、流通分三部分，温陵、长水两位大师所判定的分科也大致相同。而在正宗分里，又开列为见道分、修道分、证道分、结经分、助道分这五科，也非常契合经文的义理。

第一是见道分，从阿难尊者启请佛法开始，一直到宣说“胜义中真胜义性”，目的是让修行人最初就能清楚见到自己那常住不灭的真心，以此作为修行的准则和方向。

第二是修道分，从阐明“初心二决定义”开始，一直到宣说神咒，目的是让修行人依据真实的见解而发起真正的修行，不在心性之外另去造作追求。

第三是证道分，从解释“什么叫做乾慧之地”开始，一直到圆满成就妙觉果位，成就无上佛道，目的是让修行人明白，因地修行如果正确，果地证悟自然端正；如果因地不真，果报就会曲折迂回。

第四是结经分，从“这部经叫什么名字”开始，到“你们应当信奉受持”为止，目的是让修行人了解经文的五种名称含义，都包含在此经题目“大佛顶如来密因修证了义诸菩萨万行首楞严”这二十个字当中。

第五是助道分，从地狱等七趣众生开始，一直到细微的魔事境界，目的是让修行人将正修与助行相互配合，持戒与智慧二者并重，这样就能迅速到达一切种智的智慧大海。

至于经文中间更细的分科条目，各家或许稍有不同，也没有大的妨碍。后学之人只须遵循古德的科判，不必另外创立新的分科，增加繁琐碎碎的条目，才能正确理解经义。我因此应当与大家共同遵循这一科判。