邓尉山位于江苏吴县西山中，山距县城七十里，逶迤十里，周围三十里许，高五百余丈，中峦隆起。旧名大尖，相传东汉邓尉隐于山中，故名邓尉山，后晋青州刺史郁泰玄葬于山之西南六里处，名玄墓山，两山相连，实为一山，后世名玄墓者，即邓尉山也。山之南麓有一寺，曰圣恩寺，寺枕邓尉而瞰太湖，备山湖之壮观。寺始建于唐天宝间（七四二～七五五），时称天寿禅寺，宋宝祐间（一二五三～一二五八）又建圣恩禅庵，元季寺毁庵存，时有万峰禅师卓锡于此，开山说法，于明洪武九年（一三七六）辟建观音阁；普寿构法堂；普隐等建大殿、斋厨、三塔院；普持铸巨钟，建层楼。永乐七年（一四〇九）智璇重修大殿，建藏经阁。正统八年（一四四三）道立奏请赐额「圣恩寺」。崇祯元年（一六二八）建大法堂，修万峰塔，建文殊堂；六年（一六三三）法藏修大殿佛阁，建方丈，弘璧又重建天王殿，新建大悲堂，造毘卢像，大藏经供佛阁等；此有明一代之建置沿革也。万峰禅师乃本寺之开山祖师，本寺明代以前之建置则不详焉。万峰以降，古德相望，皆衍临济之传，为禅门作后起龙象。明嘉靖间，沈润卿撰「邓尉山志」；崇祯年间，周永年取沈志增益纂为「邓尉山圣恩寺志」十八卷，分门二十四：形胜、泉石、梵宇、禅祖、名释、圣制、颁赐、奏对、谢表、奏疏、公移、碑记、寺记、语录、录序、募疏、请疏、塔庙、祠墓、塔铭、钟部、游记、题咏、杂文。卷首绘图，总揽形势，王焕如撰图说，并参订全稿，熊开元为之裁定。民国十九年（一九三〇）时圣恩寺住持释中恕以年烟版毁，乃取存本影印，按此本后人曾有增辑，内间有顺治、康熙间事。兹据民国十九年圣恩寺影明崇祯至清康熙间刊本景印。
邓尉山在江苏吴县的西山里，离县城七十里路，山势蜿蜒十里，方圆大约三十里，高五百多丈，中间的山峰高高隆起。它旧名叫大尖，相传东汉的邓尉曾隐居在这山里，所以就叫邓尉山。后来，西晋的青州刺史郁泰玄葬在山西南六里的地方，那里就叫玄墓山。其实两座山是连着的，就是同一座山，后世所说的玄墓山，也就是邓尉山。山的南边山脚下有一座寺庙，叫圣恩寺。寺庙背靠邓尉山，俯瞰太湖，拥有山和湖的壮丽景色。
寺庙最初建于唐朝天宝年间（公元742到755年），当时叫天寿禅寺。宋朝宝祐年间（1253到1258年），又建了圣恩禅庵。元朝末年，寺庙毁坏了，但庵堂还在。那时有位万峰禅师来到这里，开山说法。明朝洪武九年（1376年），他修建了观音阁；普寿建造了法堂；普隐等人建了大殿、斋堂厨房和三座塔院；普持铸造了大钟，建起了多层楼阁。
永乐七年（1409年），智璿重修了大殿，并建了藏经阁。正统八年（1443年），道立上奏请求皇帝赐予匾额，于是得名“圣恩寺”。崇祯元年（1628年），修建了大法堂，修缮了万峰塔，建了文殊堂。崇祯六年（1633年），法藏修缮了大殿和佛阁，建了方丈室；弘璧又重建了天王殿，新建了大悲堂，塑造了毗卢遮那佛像，将大藏经供奉在佛阁里。以上就是明朝一代的修建和变迁情况。
万峰禅师是这座寺庙的开山祖师。至于明代以前的寺庙修建情况，就不太清楚了。从万峰禅师以后，历代高僧辈出，他们都传承临济宗的法脉，是禅门后来的杰出人物。
明朝嘉靖年间，沈润卿撰写了《邓尉山志》。崇祯年间，周永年以沈润卿的志书为基础，增补内容，编纂成《邓尉山圣恩寺志》，共十八卷，分为二十四个门类：形胜、泉石、梵宇、禅祖、名释、圣製、颁赐、奏对、谢表、奏疏、公移、碑记、寺记、语录、录序、募疏、请疏、塔庙、祠墓、塔铭、钟部、游记、题咏、杂文。卷首有绘图，总体展现山川形势，图说由王焕如撰写，他也参与了全书的校订，最后由熊开元审定。
民国十九年（1930年），圣恩寺的住持中恕和尚，因为原版年久损毁，就用保存下来的本子影印。这个本子后来还有人增补过，里面夹杂了一些清朝顺治、康熙年间的事情。现在这个影印本，是根据民国十九年圣恩寺影印的、从明崇祯到清康熙年间刊印的本子制作的。