第三明宗者，修行之喉衿，显体之要蹊。如梁柱持屋，结网纲维。提维则目动，梁安则桷存。葢因果之宗，是一经显体之要也。今略录其三：初简宗体，二正明宗，三众经同异。
初、简宗体者，有人言：宗即是体，体即是宗。今所不用。何者？宗致既是因果，因果即二；体非因果，体即不二。体若是二，体即非体；体若不二，体即非宗；宗若不二，宗即非宗；宗若是二，宗即非体。云何而言体即是宗，宗即是体？又柱梁是屋之纲维，屋空是梁柱所取，不应以梁柱是屋空，屋空是梁柱。宗体若一，其过如是。又宗体异者，则二法孤调，宗非显体之宗，体非宗家之体。宗非显体之宗，宗则邪倒无印；体非宗家之体，则体狭不周。离法性外，别有因果。宗体若异，其过如是。今言不异而异，约非因非果而论因果，故有宗体之别耳。释论云：若离诸法实相，皆名魔事。普贤观云：大乘因者，诸法实相；大乘果者，诸法实相。即其义也。当知实相体通而非因果，行始辨因，行终论果耳。
二、正明宗者，此经始从序品讫安乐行品，破废方便，开显真实佛之知见，亦明弟子实因实果，亦明师门权因权果。文义虽广，撮其枢要，为成弟子实因，因正果傍，故于前段明迹因迹果也。从涌出品讫劝发品，废迹显本，废方便之近寿，明长远之实果，亦明弟子实因实果，亦明师门权因权果。文义虽广，撮其枢要，为显师之实果，果正因傍，故于后段明本因本果。合前因果，共为经宗，意在于此。所以经分二文，论本论迹，双题法譬，举莲举华，师弟权实，总在其间也。
三众经因果同异者，谓迹因果或同或异，本因果永异。迹因果者，实相通印诸体，何经不约此以论因果？大品明非因非果实相为体，而但因为宗，般若遣荡正是因意，故云菩萨心中名般若，在佛心中名萨婆若。文中亦说菩萨无生灭因，获不断不常萨婆若果。叡师序云：启玄章以不住为始，归三慧以无得为终，终始因果也。文中亦说一切种智佛果为成般若之因，因正果傍无量义宣说摩诃般若历劫修行，故知彼经用因为宗也。净名用佛国因果两义为宗，宝积具问因果，佛备答因果，故知双用因果为宗也。华严圆顿之教解宗不同，或言用因为宗，据题言华严是万行庄饰修因之义，文中说四十地行相，故用因为宗。又云果为宗，据题云大方广佛，佛是极果之名，华严是定慧万善庄严佛身非庄严因，文中多说舍那法身之事，即用果为宗也。又解云：因果合为宗，如言佛即是果，华严即是因，文中具说法身亦说诸地，俱用因果为宗。诸经对缘不同，故明宗互异耳。般若通对三人，傍真因果此义则异，别对菩萨复有利钝，为钝明因此义亦异，利人因者此义则同。净名佛国义兼，若三种佛国因果此义则异，一种佛国因果者则同。华严亦对两缘，钝异利同如前分别。又将此意历五味因果例可知，是为众经因果与迹门同异之相也。二、本门因果永异众经者，若三藏菩萨始行实因果无权因果，乃至明佛道树始成非久远本迹，通教菩萨亦始行因神通变化而论本迹，非久远本迹也。大品说菩萨有本迹，二乘则无，说佛始得生法二身本迹不说久远。净名不说声闻有本迹，但明菩萨住不思议之本迹，说佛有净土螺髻所见亦非久远。华严说舍那释迦为本迹，菩萨亦有本迹，声闻尚不闻不解，云何自有本迹？今经发声闻有本、本有因果，示为二乘迹中因果发佛之迹，王宫生身生、道树法身生，乃至中间生法二身悉皆是迹，但取最初先得真应名之为本，故师弟本因本果与余经永异。今经迹中师弟因果与众经有同有异，本中师弟因果众经所无，正以此之因果为经玅宗也。