此经二十八品。大科为三分。前序一品。以彰说法之由致。判为序分。正宗一分二十七品。以开示悟入四字科之。从方便品。至法师品九品。为开佛知见。见宝塔一品。为示佛知见。从提婆达多品。至嘱累品十一品。为悟佛知见。从药王本事品。至普贤劝发品六品。为入佛知见。开示悟为信解。入为行证。品末数句。为流通分。以终焉。
这部经共有二十八品，主要分为三大部分。开头的序品是第一分，说明佛陀说法的缘起，称为序分。主体部分包含二十七品正宗分，可以用"开、示、悟、入"四个字来划分：从《方便品》到《法师品》共九品，是开启佛的知见；《见宝塔品》一品，是显示佛的知见；从《提婆达多品》到《嘱累品》共十一品，是领悟佛的知见；从《药王本事品》到《普贤劝发品》共六品，是证入佛的知见。其中开、示、悟三阶段属于信解，入阶段属于修行证果。各品末尾的几句话是流通分，作为全经的终结。